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Test d’amplification des acides nucléiques pour les MST

by Jean-Charles Bourgeois
15/12/2021
0

Les tests d’amplification des acides nucléiques, également appelés NAAT, sont utilisés pour identifier de petites quantités d’ADN ou d’ARN dans les échantillons de test. Ils peuvent donc être utilisés pour identifier des bactéries, des virus et d’autres agents pathogènes même lorsque le matériel d’intérêt est présent en très petites quantités. Les TAAN peuvent même détecter une variété de différentes maladies sexuellement transmissibles (MST). En fait, la plupart des tests d’urine pour les MST sont effectués à l’aide de TAAN.

Un échantillon de sang est détenu avec une rangée d'échantillons humains pour des tests analytiques, y compris le sang, l'urine, la chimie, les protéines, les anticoagulants et le VIH en laboratoire

Andrew Brookes/Cultura/Getty Images

Comment fonctionnent les tests d’amplification des acides nucléiques ?

Bien qu’il existe plusieurs types de NAAT, tous sont basés sur les mêmes principes. Tout d’abord, les scientifiques doivent déterminer la séquence des acides nucléiques qu’ils souhaitent identifier et fabriquer des sondes qui s’y attachent. Ensuite, le NAAT utilise une série de réactions chimiques répétées pour faire de nombreuses copies de l’ADN ou de l’ARN que les médecins tentent de détecter. Ces réactions amplifient sélectivement le signal des acides nucléiques intéressants dans l’échantillon à tester afin qu’ils soient plus faciles à identifier. Il est beaucoup plus simple de trouver 10 000 copies d’un gène que 10.

Qu’est-ce que cela a à voir avec les tests STD ?

Le processus d’amplification des acides nucléiques bactériens ou viraux n’est pas en soi le test STD. Au lieu de cela, une fois que la quantité d’ADN ou d’ARN a été augmentée dans l’échantillon par PCR ou LCR, des tests plus conventionnels sont utilisés pour le détecter.

Ces tests impliquent généralement une certaine forme d’hybridation d’acide nucléique. Dans ces tests, l’échantillon est sondé avec un brin complémentaire d’ADN ou d’ARN produit artificiellement qui a été marqué d’une manière qui le rend facile à détecter. Il peut être utile de l’imaginer comme une étiquette qui brille dans le noir qui ne colle qu’à une information d’identification très spécifique.

Les NAAT sont incroyablement utiles pour les tests STD. Ils permettent aux médecins de détecter un agent pathogène MST même lorsque seul un très petit nombre d’organismes sont présents.

La technologie des tests d’acides nucléiques a permis d’effectuer des tests d’urine pour les MST qui n’étaient auparavant détectables que par écouvillonnage.

De plus, étant donné que les TAAN sont incroyablement sensibles à même de petites quantités d’ADN viral, ils sont très importants pour le dépistage de l’approvisionnement en sang. Ces tests permettent de détecter de minuscules quantités de VIH et d’autres agents pathogènes transmissibles par le sang qui pourraient autrement passer inaperçus.

Exemple de ce test en action

Les TAAN sont des méthodes incroyablement sensibles pour détecter si une bactérie ou un virus est présent dans un échantillon biologique. Lorsqu’il s’agit de détecter l’herpès génital dans une plaie d’une personne qui présente des symptômes, ces tests constituent une alternative viable à la culture virale. Les cultures virales peuvent être difficiles à réaliser pour certains laboratoires.

Contrairement aux tests sanguins de l’herpès, un TAAN implique toujours la détermination directe de la présence d’un virus dans l’échantillon plutôt que la recherche d’anticorps anti-herpès.

L’amplification des acides nucléiques a également permis une expansion du dépistage de la chlamydia et de la gonorrhée dans tout le pays. Désormais, un tel dépistage peut désormais être effectué sur des échantillons d’urine au lieu de nécessiter un écouvillonnage urétral ou cervico-vaginal.Il est donc devenu facile de tester un grand nombre de jeunes hommes et femmes pour ces MST dans une variété de contextes cliniques et non cliniques. La collecte d’urine ne nécessite aucune expertise médicale. Les gens sont également plus susceptibles de vouloir faire pipi dans une tasse que de subir un écouvillonnage génital.

Les chercheurs ont également utilisé les NAAT pour obtenir plus d’informations sur l’étendue du problème des MST asymptomatiques aux États-Unis. Des programmes de dépistage à grande échelle basés sur le NAAT ont été mis en œuvre dans l’armée,chez les adolescents urbains, chez les hommes ayant des rapports sexuels avec des hommes et dans d’autres groupes à haut et à faible risque. Ces tests permettent de détecter les MST dans les petits échantillons d’urine ou de sang qui sont souvent prélevés dans le cadre de vastes études de recherche sur la santé de la population.

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