Qu’est-ce que le coronavirus humain NL63 ?

Coronavirus humain NL63 (HCoV-NL63) est une espèce de coronavirus. Plus précisément, il s’agit d’un Setracovirus du genre Alphacoronavirus. Le coronavirus humain NL63 (HCoV-NL63) a été identifié fin 2004 chez un enfant de sept mois atteint de bronchiolite aux Pays-Bas. Le virus est un virus à ARN simple brin enveloppé de sens positif qui pénètre dans sa cellule hôte en se liant à l’ACE2. L’infection par ce virus a été confirmée dans le monde entier et est associée à de nombreux symptômes et maladies courants. Les maladies associées comprennent les infections des voies respiratoires supérieures légères à modérées, les infections graves des voies respiratoires inférieures, le croup et la bronchiolite.

Le coronavirus humain NL63 (HCoV-NL63) se trouve principalement chez les jeunes enfants, les personnes âgées et les patients immunodéprimés atteints de maladie respiratoire aiguë. Ce virus a également une association saisonnière dans les climats tempérés. Une étude réalisée à Amsterdam a estimé la présence de HCoV-NL63 dans environ 4,7% des maladies respiratoires courantes. Ce virus provient de civettes palmistes et de chauves-souris infectées. Les estimations de sa divergence par rapport à un autre coronavirus (HCoV-229E) datent d’environ 1000 ans ; ce virus a probablement circulé chez l’homme pendant des siècles.

L’évolution du HCoV-NL63 semble avoir impliqué une recombinaison entre un virus ancestral de type NL63 circulant chez les chauves-souris africaines Triaenops afer et un virus de type CoV 229E circulant chez les chauves-souris Hipposideros. Des virus recombinants peuvent apparaître lorsque deux génomes viraux sont présents dans la même cellule hôte.

Symptômes de l’infection par le HCoV-NL63

Les premiers cas d’infection par le HCoV-NL63 ont été trouvés chez de jeunes enfants atteints d’infections graves des voies respiratoires inférieures admis dans les hôpitaux. Bien que la présentation clinique du virus puisse être sévère, il a également été trouvé dans des cas bénins d’infection respiratoire. La comorbidité du HCoV-NL63 avec d’autres infections respiratoires a rendu les symptômes spécifiques du virus difficiles à cerner. Une étude des symptômes cliniques chez des patients HCoV-NL63 sans infection secondaire a signalé que les symptômes les plus courants étaient la fièvre, la toux, la rhinite, les maux de gorge, l’enrouement, la bronchite, la bronchiolite, la pneumonie et le croup. Une première étude portant sur des enfants atteints d’une maladie des voies respiratoires inférieures a révélé que le HCoV-NL63 était plus fréquemment retrouvé chez les patients ambulatoires que chez les patients hospitalisés, ce qui suggère qu’il s’agit d’un virus du rhume similaire au HCoV-229E et au HCoV-OC43. Ces deux virus provoquent généralement des symptômes moins graves. Cependant, la fréquence élevée du croup est spécifique à l’infection par le HCoV-NL63.

Cause de l’infection au coronavirus NL63

On pense que la voie de propagation du HCoV-NL63 se fait par transmission directe de personne à personne dans les zones très peuplées. Le virus peut survivre jusqu’à une semaine à l’extérieur du corps dans des solutions aqueuses à température ambiante et trois heures sur des surfaces sèches. La plupart des gens seront infectés par un coronavirus au cours de leur vie, mais certaines populations sont plus sensibles au HCoV-NL63. Ces populations comprennent les enfants de moins de 5 ans, les personnes âgées et les personnes immunodéprimées. Ce virus semble avoir une incidence saisonnière, survenant le plus souvent pendant les mois d’hiver dans les climats tempérés. Dans les climats plus extrêmes et tropicaux, le virus n’a aucune préférence pour une saison particulière. De nombreuses études ont signalé la co-occurrence du HCoV-NL63 avec d’autres coronavirus humains, tels que Virus de la grippe A, Orthopneumovirus humain (VRS), le virus parainfluenza et métapneumovirus humain (hMPV).

Mécanisme d’infection virale

La transmission du HCoV-NL63 est probable par l’expulsion de gouttelettes des voies respiratoires, qui peuvent être en suspension dans l’air ou se propager par contact personnel étroit. Le virus est capable de survivre jusqu’à sept jours dans les sécrétions respiratoires et reste infectieux à température ambiante. Une fois que le virus est entré dans l’hôte, il se lie aux récepteurs cellulaires à l’aide de protéines de pointe. Le virus est capable d’utiliser l’enzyme de conversion de l’angiotensine 2 (ACE2) comme récepteur d’entrée pour se lier aux cellules cibles et y pénétrer. Aucune détermination de l’entrée spécifique du virus dans la cellule hôte n’a été effectuée. Par conséquent, l’entrée dans la cellule se fait soit par fusion cellulaire directe avec la membrane plasmique, soit par endocytose suivie d’une fusion avec la membrane. En raison de l’absence d’un clone d’ADNc de HCoV-NL63, la recherche sur le cycle de réplication est limitée. Parce qu’il s’agit d’un virus à ARN simple brin positif, les processus de réplication via la transcription et la traduction peuvent être effectués dans le cytoplasme de la cellule infectée.

Diagnostic de l’infection par le virus HCoV-NL63

Il est difficile de faire la distinction entre les symptômes causés par l’infection par le virus HCoV-NL63 et ceux causés par d’autres virus humains courants, ce qui rend le diagnostic et la détection complexes. La réaction en chaîne par polymérase de transcription inverse d’échantillons prélevés par écouvillonnage nasopharyngé est la méthode la plus couramment utilisée pour la détection du virus. La culture virale ou la recherche d’anticorps dans le sérum sanguin peuvent également être utilisées pour la confirmation de l’infection.

La prévention de Infection par le virus HCoV-NL63

Les Centers for Disease Control and Prevention (CDC) recommandent plusieurs mesures pour la prévention de l’infection par le HCoV-NL63, notamment : se laver les mains souvent à l’eau et au savon, éviter tout contact étroit avec des personnes malades et ne pas toucher les yeux, la bouche ou le nez.

Traitement et pronostic

Le traitement du virus HCoV-NL63 dépend de la gravité de la symptomatologie associée. La plupart des infections légères à modérées disparaissent d’elles-mêmes. Les symptômes peuvent être soulagés en prenant un analgésique ou un médicament contre la fièvre, en prenant une douche chaude ou en utilisant un humidificateur. Un traitement antiviral peut être nécessaire pour les patients infectés qui se retrouvent dans l’unité de soins intensifs (USI) en raison d’une infection respiratoire aiguë. L’immunoglobuline intraveineuse est un inhibiteur du HCoV-NL63 approuvé par la FDA qui est également utilisé pour traiter le déficit immunitaire primaire, le VRS et la maladie de Kawasaki.

Virologie

HCoV-NL63 est l’un des 7 coronavirus connus pour infecter les humains. Les six autres coronavirus sont :

Coronavirus humain 229E (HCoV-229E)
Coronavirus humain OC43 (HCoV-OC43)
Coronavirus humain HKU1 (HCoV-HKU1)
Coronavirus lié au syndrome respiratoire du Moyen-Orient (MERS-CoV)
Coronavirus du syndrome respiratoire aigu sévère (SARS-CoV-1)
Syndrome respiratoire aigu sévère coronavirus 2 (SARS-CoV-2)

Recherche récente

Des données récentes suggèrent une association entre l’infection par le HCoV-NL63 et la maladie de Kawasaki. La maladie de Kawasaki est une vascularite systémique de l’enfance qui peut entraîner des anévrismes des artères coronaires. Dans les pays développés, la maladie de Kawasaki est la cause la plus fréquente de maladie cardiaque acquise chez les enfants. Une analyse plus approfondie de la pathogénicité du HCoV-NL63 semble justifiée, en particulier en raison de preuves récentes que ce virus utilise le même récepteur cellulaire (ACE2) que le SARS-CoV (l’agent causal du SRAS) et le SARS-CoV-2 (l’agent causal du COVID-19), et provoque une réponse immunitaire similaire. HCoV-NL63 a également été trouvé dans le tractus intestinal des personnes infectées et lié à la gastro-entérite. Ce type d’infection est le résultat direct de l’invasion virale de la muqueuse intestinale. Le rôle du HCoV-NL63 dans la gastro-entérite n’est pas clair en raison de la co-infection typique avec d’autres virus dans cette maladie. Le HCoV-NL63 est probablement sous-détecté en raison de son rôle dans de nombreuses infections respiratoires légères à modérées et de la comorbidité avec d’autres maladies. Les chercheurs ont suggéré que des études plus complètes et basées sur la population sont nécessaires pour déterminer les effets de ce virus sur les systèmes en dehors des voies respiratoires.